《口袋妖怪：永恒之沫4.0gba版》是这款口袋妖怪改版游戏的最终版本，这个版本其实并没有做出多大的修改，除了修复游戏平衡性的问题和一些BUG外，还屏蔽了修改器以及改版工具，当然，玩家还是可以使用金手指的。虽然并没有增加剧情内容，但是《口袋妖怪：永恒之沫4.0》加入了mega类以及第六代精灵等，喜欢口袋妖怪的玩家推荐试试这个版本。
神秘商人
武斗镇格斗系道馆旁边的神秘商贩调整：
出售的商品从原来的 全树果全信封 调整为 仅售 全信封
然后信封的价格，从原先的50元统一提高为150元。
另外，热带、梦幻、奇迹、怀旧信封价格调整为200元。
相对应的，新增了一个神秘商贩。设定为树果的出售，出售地点为123号道路。
然后树果的价格，从原来的20元统一提高为50元。
另外，奇拉果、龙佳果、天速果、红龙果、青杏、红阳、绿星果的出售价格调整为150元。
游戏特色
1、读取精灵信息的界面色盘微调。
2、全新的精灵种类：白精灵和黑精灵
3、全新的剧情内容：三周目内容挑战
4、优化游戏界面和战斗背景
5、全新的封面和道具内容
6、将游戏中的超梦mega形态转换调整。
7、全区 部分定点神兽捕捉等级调整
8、 游戏中的定点神秘商贩调整
