《蜡笔物理学》游戏操作也相当简单，遵循严格的物理定律, 让小球碰到黄色星星：通过你用一支“蜡笔”绘制各种形状的方块，石头，线条等来让这个苹果碰到小星星就成功了。
大家可以发挥自己的想象力，更换蜡笔颜色（鼠标滚轮）， 橡皮擦（右键）， 施展你的才华，丰富的机关搭配可以有意想不到的效果，到后面还有各种特殊道具等候你哦！游戏会在你过关的过程中不断教你使用各种道具。 苹果要克服重重困难, 誓要集齐世界上所有的星星. 游戏分为8个大陆, 超过70个关卡, 难度由浅入深. 过程中要留意作者给的提示 还支持关卡设计. 工具左上是蜡笔, 移动, 和绳索, 下方一次是图钉, 小球, 星星, 高级工具:轴, 方向标记和导弹. 蜡笔是基本绘画工具, 移动工具可以使图案做360°旋转, 绳索链接图钉会有吊链, 弹簧床的效果. 图钉还可以固定住用蜡笔画的图形使之成为成为背景, 方向标记到一个图钉上, 会让图钉所在位置的图形向标记所指的方向旋转. 轴和导弹都是游戏中可以使用的工具. 后者特别有趣. 设计完毕后,按下右下角的PLAY就可以玩了。
